*88年10月15日：長庚大學於全台首度設置呼吸照護學系，並由蔡熒煌教授擔任系主任。

*90年10月12-14日：與呼吸照護學會共同主辦第十屆亞太呼吸照護年會暨第一屆世界呼吸照護大會。

*90年12月3日：與呼吸照護學會共同推動呼吸治療師立法通過。

*91年1月15日：為培養從事呼吸照護相關研究人才，促進國內對醫療教育之重視，本系與昭華教育基金會共同設立呼吸照護研究獎助學金。

*91年7月1日：本系開設暑期推廣教育學分班，反應良好並造成班班爆滿情況。

*91年10月：本系首屆在職專班畢業生參加專技人員高等考試，錄取率達87﹪。

*92年10月：本系第二屆在職專班畢業生參加專技人員高等考試，錄取率達89﹪。

*92年8月1日：本系專任教師施玫如老師獲准赴美加州大學舊金山分校護理博士班進修。

*93年2月1日：本系專任教師萬國華助理教授獲准美國哈佛大學公衛學院博士後研究員。

*94年6月21日：奉准於95學年度起增設招收大學部四年制一般生35名。

*95年12月3日：與台灣呼吸治療學會於本校國際會議廳協辦第三屆呼吸治療師節慶祝大會暨學術研討會。

*96年10月15日：教務處「增設調整院系所學位學程及招生名額總量發展審查會議」決議同意本系自 97學年度起於臨研所增設呼吸暨重症照護組，招生名額五名。

*97年12月：本系接受財團法人高等教育評鑑中心97學年度系所評鑑審查通過。

*98年4月10日：與美國德州大學聖安東尼奧分校呼吸照護學系簽訂學術交流合作。

*98年12月12-13日：與台灣胸腔暨重症加護醫學會協辦第14屆會員大會暨學術研討會。

*99年8月24日：本系大學部第一屆畢業生參加呼吸治療師專技高考錄取率達96.3％，全國第一。

*99年12月18日：黃崇旂副教授接任本系系主任。

*100年8月：本系大學部第二屆畢業生參加呼吸治療師專技高考錄取率達97％，全國第一。

*100年8月1日：本系獲准更名為呼吸治療學系。

*100年8月：黃崇旂主任榮升為教授。

*101年2月：陳妍慧講師獲准進修師範大學體育系博士班。

*101年3月2日：與美國喬治亞州立大學呼吸照護學系合辦呼吸治療設備研發工作坊 。

*101年8月：本系大學部第三屆畢業生參加呼吸治療師專技高考錄取率達95.24％，連續三年全國第一。

*101年11月：林蕙鈴老師獲選美國AARC Fellow。

*102年3月：與美國喬治亞州立大學呼吸照護學系簽訂學術交流合作

*103年9月:本系大學部第五屆應屆畢業生參加呼吸治療師專技高考率取率達96.88%，且連續五年全國第一。

*104年9月:本系大學部第六屆應屆畢業生參加呼吸治療師專技高考及格率100%，並考取榜首:曹育嘉，榜眼:陳彥儒同學。

*105年2月:本系萬國華老師榮升為教授，陳妍慧老師榮升助理教授。

*107年9月:本系萬國華教授榮獲107年度優良教師輔導獎

*107年11月:本系高國晉老師榮升為教授，林蕙鈴老師榮升副教授

*108年11月:本系賴盈如老師榮升副教授

*108年12月:本系萬國華教授榮獲108年度教育部優良導師獎

*109年8月:本系謝孟哲老師榮升副教授

*111年7月:本系賴盈如老師研究論文發表於 The Journal of Clinical Investigation (JCI) (臨床研究雜誌)國際頂尖期刊。(SCI, 2021 IF=19.456)

*111年11月:本系林蕙鈴老師榮升教授，陳妍慧老師榮升副教授

*111年12月:本系蔡熒煌教授入榜2021 年全球前 2% 頂尖科學家