本系目前專業必修課程檔修規定為：

1.「呼吸器生理及臨床運用、呼吸器生理及臨床運用實驗」需修及格後方能修讀「重症呼吸照護學、重症呼吸照護學實習」

2.「重症呼吸照護學、重症呼吸照護學實習」需修及格後方能修讀「綜合臨床實習」

3. 重症呼吸照護實習需修及格後方能修讀「小兒呼吸照護學實習、長期呼吸照護學實習」